Strategi pelestarian keanekaragaman hayati dan pengurangan emisi oleh USAID SEGAR didasari pada upaya mendukung pemangku kepentingan utama di daerah agar lebih memahami dan melindungi bentang alam daratan yang memiliki nilai konservasi tinggi (NKT) dan stok karbon tinggi (SKT). Pemerintah daerah akan lebih mampu menentukan wilayah yang memungkinkan untuk pembangunan ekonomi – seperti produksi komoditas berkelanjutan – serta meningkatkan kondisi pendukung (enabling environment). USAID SEGAR juga akan memberikan dukungan yang ditujukan untuk pelestarian satwa liar.